Der Aufgabenbereich des MWFK ist mit der Pflege und Förderung von Wissenschaft und Kultur der eines „Zukunftsministeriums“: Erstklassige Forschung und Lehre an den Brandenburger Hochschulen in enger Kooperation mit den außeruniversitären Forschungseinrichtungen und der Wirtschaft sind von ebenso entscheidender Bedeutung für die Zukunft des Landes wie die Pflege des kulturellen Erbes und die Unterstützung künstlerischer Kreativität.
Mit drei Universitäten, fünf Fachhochschulen, der Hochschule für Film und Fernsehen in Potsdam-Babelsberg sowie den zahlreichen außerhochschulischen Forschungsinstituten besitzt das Land Brandenburg große Wissenschafts- und Forschungspotenziale. Diese Potenziale zu nutzen und weiter auszubauen, ist die zentrale Aufgabe der Abteilung „Wissenschaft und Forschung“ des Ministeriums. Hierbei setzt das MWFK konsequent auf Nachwuchsförderung, die insbesondere im zukunftsträchtigen MINT-Bereich von großer Bedeutung für die Leistungsfähigkeit des Wissenschaftsstandortes Brandenburg ist. Das MWFK fördert entsprechend bereits seit Jahren eine Vielzahl von innovativen Projekten, die darauf abzielen, das Interesse für naturwissenschaftlich-technische Zusammenhänge bei Jugendlichen zu wecken. Speziell junge Frauen sollen durch diese Projekte für den MINT-Bereich begeistert werden. Mit seinem Qualitätsversprechen „Kinder und Karriere“ setzt das MWFK zudem konsequent auf familienfreundliche Hochschulen, um Wissenschaft und Forschung für junge Eltern, insbesondere Mütter, attraktiver zu machen.